不含染料的 MasterMix 产品在 PCR 结束后需混合适量的上样缓冲液再上样电泳, 含染料的 MasterMix 产品在 PCR 结束后可以直接上样电泳。
不含染料的 MasterMix 产品在 PCR 结束后需混合适量的上样缓冲液再上样电泳, 含染料的 MasterMix 产品在 PCR 结束后可以直接上样电泳。
(注意:以下举例为常规PCR体系和反应条件,实际操作中应根据模板、引物结构和目的片段大小 不同进行相应的调整和优化) 1. PCR体系 推荐反应体系(20 μl)试剂用量模板 DNAPrimer 1 (10 μM)0.5 μlPrimer 2 (10 μM)0.5 μl2×Pfu PCR MasterMix10 μlddH2OUp to 20 μl(注意:引物浓度请以终浓度 0.1 - 1.0 μM 作为设定范围的参考。扩增效率不高的情况下,可提高引 物的浓度;发生非特异性反应时,可降低引物浓度,由此优化反应体系) 2. PCR 程序过程温度时间预变性94℃2 min变性94℃30 sec25 ~ 35cycles 退火55 ~ 65℃30 sec延伸72℃60 sec/kb最后延伸72℃5 min(注意:a 一般实验中退火温度比扩增引物的熔解温度 Tm 低 5℃,无法得到理想的扩增效率 时,适当降低退火温度;发生非特异性反应时,提高退火温度,由此优化反应条件。b 延伸时间应 根据所扩增片段大小设定,Pfu DNA Polymerase 的扩增效率为1 kb/min。c 可根据扩增产物的下游 应用设定循环数。如果循环次数太少,扩增量不足;如果循环次数太多,错配机率会增加,非特异 性背景严重。所以,在保证产物得率的前提下,应尽量减少循环次数) 3. 结果检测:反应结束后取5 μl反应产物,加入适量上样缓冲液(含染料的不用加), 然后进行琼脂糖凝胶电泳检测。
(注意:以下举例为常规PCR体系和反应条件,实际操作中应根据模板、引物结构和目的片段大小 不同进行相应的调整和优化) 1. PCR体系 推荐反应体系(20 μl)试剂用量模板 DNAPrimer 1 (10 μM)0.5 μlPrimer 2 (10 μM)0.5 μl2×Pfu PCR MasterMix10 μlddH2OUp to 20 μl(注意:引物浓度请以终浓度 0.1 - 1.0 μM 作为设定范围的参考。扩增效率不高的情况下,可提高引 物的浓度;发生非特异性反应时,可降低引物浓度,由此优化反应体系) 2. PCR 程序过程温度时间预变性94℃2 min变性94℃30 sec25 ~ 35cycles 退火55 ~ 65℃30 sec延伸72℃60 sec/kb最后延伸72℃5 min(注意:a 一般实验中退火温度比扩增引物的熔解温度 Tm 低 5℃,无法得到理想的扩增效率 时,适当降低退火温度;发生非特异性反应时,提高退火温度,由此优化反应条件。b 延伸时间应 根据所扩增片段大小设定,Pfu DNA Polymerase 的扩增效率为1 kb/min。c 可根据扩增产物的下游 应用设定循环数。如果循环次数太少,扩增量不足;如果循环次数太多,错配机率会增加,非特异 性背景严重。所以,在保证产物得率的前提下,应尽量减少循环次数) 3. 结果检测:反应结束后取5 μl反应产物,加入适量上样缓冲液(含染料的不用加), 然后进行琼脂糖凝胶电泳检测。
1. 去除基因组:根据以下表格配制反应体系,总体积为 10μl。为了保证反应液配制的准 确性,先按反应数+2 的量配制预混体系,然后再分装到每个反应管中,最后加入 RNA。10×gDNA Remover1 μlRNA 模板0.01~1μgDEPC-ddH2O补足至 10μl(注意:如果总 RNA 量大于 1 ug,请按比例扩大反应体系)将反应液轻轻搅拌均匀,短暂离心使管壁上的溶液收集到管底,室温或 25-37℃温育 5 分钟。 2. 反转录反应:在上述反应液中加入 4μl 5×cDNA RT Mix,6μl DEPC-ddH2O,轻轻混匀, 短暂离心;50℃孵育 5-15 分钟;85℃加热 3 分钟使酶失活;置于冰上进行后续实验或 冷冻保存。 注意:Real-time qPCR 时,作为模板直接稀释后添加(添加到 PCR 反应液中的反转录稀释液,尽 量不要超过 20%,以免导致 PCR 反应效率低下,无法准确定量)
1. PCR 体系:推荐体系(50 μl)试剂用量模板 DNA10 × Taq PCR Buffer5 μldNTP Mixture(2.5 mM each)4 μlPrimer 1 (10 μM)2 μlPrimer 2 (10 μM)2 μlTaq DNA Polymerase (2.5 U/μl)0.5 ~ 1 μlddH2OUp to 50 μl(注意:a 引物浓度请以终浓度 0.1-1.0μM 作为设定范围的参考。扩增效率不高的情况下,可提 高引物的浓度;发生非特异性反应时,可降低引物浓度,由此优化反应体系。b 镁离子浓度请以 终浓度 1.5-3mM 作为设定范围的参考。可根据不同的引物对和模板来调节镁离子浓度,由此优化反应体系)2. PCR 程序过程温度时间预变性94℃5 min变性94℃30 sec25~35cycles 退火55-65℃30 sec延伸72℃1kb/30 sec终延伸72℃5 min(注意:a 一般实验中退火温度比扩增引物的熔解温度 Tm 低 5℃,无法得到理想的扩增效率时, 适当降低退火温度;发生非特异性反应时,提高退火温度,由此优化反应条件。b 延伸时间应根 据所扩增片段大小设定,Taq DNA Polymerase 的扩增效率为 1 kb/30 sec。c 可根据扩增产物的下 游应用设定循环数。如果循环次数太少,扩增量不足;如果循环次数太多,错配机率会增加,非 特异性背景严重。所以,在保证产物得率的前提下,应尽量减少循环次数)3. 结果检测:反应结束后取 5 μl 反应产物,加入适量上样缓冲液后进行琼脂糖凝胶电泳 检测。