(注意:以下举例为常规PCR反应体系和反应条件,实际操作中应根据模板、引物结构和目的 片段大小不同进行相应的调整和优化)
1. PCR 体系:
推荐体系(50 μl)
试剂 | 用量 |
模板 DNA | < 1μg |
10 × Taq Plus Buffer | 5 μl |
dNTP Mixture(2.5 mM each) | 4 μl |
Primer 1 (10 μM) | 2 μl |
Primer 2 (10 μM) | 2 μl |
Hotstart Taq Plus DNA Polymerase (2.5 U/μl) | 0.5 ~ 1 μl |
ddH2O | Up to 50 μl |
(注意:a 引物浓度请以终浓度 0.1-1.0μM 作为设定范围的参考。扩增效率不高的情况下,可提高引物的浓度;发生非特异性反应时,可降低引物浓度,由此优化反应体系。b 镁离子浓度请以 终浓度 1.5-3mM 作为设定范围的参考。可根据不同的引物对和模板来调节镁离子浓度,由此优 化反应体系)
2. PCR 程序
过程 |
| 温度 | 时间 |
预变性 | 94℃ | 5 min |
| 变性 | 94℃ | 30 sec |
25~35 cycles | 退火 | 55-65℃ | 30 sec |
| 延伸 | 72℃ | 1kb/30 sec |
终延伸 | 72℃ | 5 min |
(注意:a 一般实验中退火温度比扩增引物的熔解温度 Tm 低 5℃,无法得到理想的扩增效率时, 适当降低退火温度;发生非特异性反应时,提高退火温度,由此优化反应条件。b 延伸时间应根 据所扩增片段大小设定,Hotstart Taq Plus DNA Polymerase 的扩增效率为 1 kb/20-30 sec。c 可 根据扩增产物的下游应用设定循环数。如果循环次数太少,扩增量不足;如果循环次数太多,错 配机率会增加,非特异性背景严重。所以,在保证产物得率的前提下,应尽量减少循环次数)
3. 结果检测:反应结束后取 5 μl 反应产物,加入适量上样缓冲液后进行琼脂糖凝胶电泳 检测。